Denne artikkelen er produsert og finansiert av UiT Norges arktiske universitet - les mer.
Slik kan KI bidra til raskere behandling mot lungekreft
Det kan gi mindre kostbare undersøkelser og mer persontilpasset kreftbehandling.
Forsker Nikita Shvetsov har utviklet et KI-system som kan by på mindre kostbare undersøkelser og mer persontilpasset kreftbehandling.(Foto: Petter Bjørklund / SFI Visual Intelligence)
Lungekreft er en av de mest utbredte og dødelige
kreftformene i verden. I 2023 fikk 3.319 nordmenn påvist lungekreft.
Når immunforsvaret oppdager kreft i lungene, sender det ut
en gruppe immunceller. De angriper de ondartede cellene i kreftsvulsten.
Disse
immuncellene kalles tumor-infiltrerende lymfocytter (TIL). De er en viktig del av kroppens kamp mot kreftsykdommer som lungekreft.
Kostbare og tidkrevende målinger
TIL-cellene kan avsløre hvordan kreften vil utvikle seg. De kan også si noe hvilken behandling som virker best.
Derfor undersøker legene vevsprøver fra
lungene gjennom mikroskop. De kartlegger TIL-cellene i svulsten. Jo flere slike
celler de finner, desto bedre er prognosen.
Problemet er at arbeidet er svært kostbart og
tidkrevende. I tillegg kan mengden celler i vevsprøvene tolkes ulikt fra lege til
lege.
– Hensikten er ikke å erstatte helsepersonell med automatiserte maskiner. Målet vårt er å gjøre livene deres litt enklere, sier forsker Nikita Shvetsov.(Foto: Petter Bjørklund / SFI Visual Intelligence)
Nå har forskere utviklet kunstig intelligens (KI) som kan
gjøre jobben enklere. Teknologien kan by på mange gevinster for
helsevesenet – fra mindre kostbare undersøkelser til raskere og mer
persontilpasset kreftbehandling.
– Vi ønsket å undersøke hvordan maskinlæring kan forenkle
dette arbeidet. Nå vet vi at det fungerer ganske godt, sier forsker Nikita Shvetsov ved UiT Norges arktiske universitet. Der deltar han i en maskinlæringsgruppe og KI-senteret SFI Visual Intelligence.
Ser forskjell på friskt, sykt og dødt lungevev
Maskinlæring handler om å få datamaskiner til å lære
noe de ikke kan fra før. Det skjer ved å trene dem på store datamengder. I Shvetsov sitt tilfelle, hundrevis med digitale snittbilder av lungevev.
Deler
av datasettet kommer fra Universitetssykehuset i Nord-Norge. Forskere der er nære samarbeidspartnere i forskningsprosjektet.
På den måten har KI-systemet hans
lært hvordan lungene ser ut – også friskt, sykt og dødt lungevev. Slik kan det
luke vekk bildedeler uten vev.
Bildet viser hvordan systemet skiller mellom friskt, sykt og dødt lungevev på et digitalt snittbilde.(Foto: Petter Bjørklund / SFI Visual Intelligence)
Teknologien faller innenfor såkalt «computational
pathology». Det er et underfelt innen digital patologi. Databaserte algoritmer brukes der for å undersøke digitale bilder av celler og vev.
Shvetsov sier dette åpner opp for mer kreative og
automatiserte måter å utføre slike undersøkelser på.
– Ved hjelp av avanserte algoritmer og metoder for maskinlæring kan maskinene finne og trekke ut de mest relevante delene fra bildene. Dette
gjør at man slipper mye manuelt arbeid. Det reduserer dessuten risikoen for feil,
forklarer han.
– Det bidrar ikke bare til mer presise analyser. Legene kan også ta raskere beslutninger. Det har betydning for pasientene, legger han
til.
Gjør arbeidet på få minutter
Annonse
Men digitale bilder er ofte store. Så store at det kan ta en
hel dag å analysere innholdet på et enkelt snittbilde – selv med KI.
En
utfordring er derfor å utvikle systemer som bruker mindre ressurser i
form av regnekraft, strøm og dyre spesiallagde grafikkprosessorer.
Systemet til Shvetsov representerer en annerledes, men mer
ressursbesparende måte å analysere slike medisinske bilder på.
– En sentral egenskap med systemet vårt er
at det ikke analyserer hele snittbildet. I første steg plukker det ut små og
tilfeldige deler fra bildet som skal behandles. Selv om det bare har undersøkt
noen få deler, gir det likevel en god oversikt over cellemengden i svulsten,
sier Shvetsov.
Bildet viser hvordan KI-systemet har markert små tilfeldige deler av snittbildet med tumor-infiltrerende lymfocytter.(Foto: Petter Bjørklund / SFI Visual Intelligence)
De neste stegene handler om å
klassifisere bildedeler med TIL-celler i seg og kartlegge
cellemengden. Det gjøres ved hjelp av en algoritme. Den gjenkjenner
cellemønstre på bildet, teller opp ulike celler og forteller hvilke av dem som
er TIL-celler.
Antallet konverteres så til en skåre. Den forteller hvor mye
TIL-celler det er i ulike steder av lungen. Eksperimenter fra studien viser at
skåren gir en nøyaktig beskrivelse av prognosen til pasienten.
Alt dette gjøres på bare noen få minutter.
Brukervennlighet står sentralt
Selve skåren er derimot ikke et godt nok grunnlag for å
stille riktig prognose, understreker Shvetsov.
Systemet må kunne vise hvordan
det har kommet fram til svaret sitt. Det er viktig for at både legene og
pasientene skal ha tillit til KI som medisinsk verktøy.
– Teknologien må med andre ord kunne gi legene visuelle
bevis. Systemet vårt gir dem derfor muligheten til å sjekke hvilke celler det
har identifisert, segmentert og klassifisert. Da kan de kvalitetssikre
resultatet og bekrefte at antallet faktisk stemmer.
For å sjekke dette på riktig måte må slike systemer være
enkle for legene å bruke. Brukervennlighet er et sentralt stikkord i
prosjektet.
Annonse
– Mangel på teknisk kompetanse kan bidra til at
helsepersonell kvier seg for å bruke KI-baserte systemer. Derfor er det viktig
at både systemet og resultatene den kommer med gir mening – selv for en
ikke-ekspert.
Kan tilpasses til andre celler og kreftformer
Et annet mål med prosjektet er å utvikle KI-teknologi
som kan justeres til andre medisinske formål.
Systemet er i utgangspunktet trent til å kartlegge TIL-celler. Likevel kan det tilpasses til å kjenne
igjen andre celletyper som kan si noe om kreftprognosen.
Systemet kan finjusteres til å måle andre markører som
er tilknyttet kroppens immunrespons. Det kan for eksempel være et eget protein kalt PD-1-protein.
– I
tillegg kan den tilpasses til andre kreftformer enn lungekreft. Selv om
det krever ekstra treningsdata, er det heldigvis lett å integrere i systemet,
sier han.
Skal støtte legene – ikke erstatte dem
Systemet er fortsatt et stykke unna fra å være et ferdig
produkt. Likevel danner forskningen til Shvetsov grunnlaget for et lovende verktøy i
helsetjenesten.
Men betyr det at legene etter hvert vil bli byttet ut med
maskiner som gjør jobben for dem?
På ingen måte, svarer han. Han understreker at slike verktøy
er ment for å støtte legene i det arbeidet. Det vil alltid være
nødvendig å ha flere mennesker i loopen – uansett hvor avansert KI-teknologi
blir.
– Slik som med andre KI-baserte verktøy er
ikke hensikten å erstatte helsepersonell med automatiserte maskiner. Målet
vårt er å gjøre livene deres litt enklere, sier han.
Et senter for forskningsdrevet innovasjon (SFI). Formålet er å utvikle nye dyplæringsmetoder for å hente ut viktig informasjon fra ulike og komplekse bildedata.
Forskerne ønsker å utvikle bedre verktøy for blant annet å oppdage hjertesykdommer og kreft, overvåke og påvise naturressurser og overvåke miljø og klima, risiko og potensielle naturkatastrofer.
Tilnærmingen til senteret er tverrfaglig. Analysemetodikk som utvikles innen ett senterområde, kan ofte være til nytte på andre fagområder.
Forskningspartnerne i senteret er UiT, Universitetet i Oslo og Norsk Regnesentral.
Senteret består også av store aktører som brukerpartnere, blant annet Universitetssykehuset Nord-Norge, Kreftregisteret, Equinor, Havforskningsinstituttet, GE Vingmed Ultrasound, Kongsberg Satelitte Services, og Aker BP.
Visual Intelligence er ett av to SFI-sentre ved UiT. Det andre er Dsolve.